Amplification-Created Restriction Site (Acrs) Method for the Detection of the Polymorphism Rs2227306 in the Interleukin 8 Gene and Interethnic Comparison of Genotype Distribution
Palavras-chave:
ACRS, Ethnic, Interleukin-8, Method, Polymorphism, rs2227306, Etnia, Interleucina-8, Polimorfismo
Resumo
O polimorfismo de base única (SNP - single nucleotide polymorphism) +781(C/T) (rs2227306) no gene interleucina (IL8) tem sido largamente investigado em estudos de associação caso-controle. Diferentes métodos têm sido utilizados para genotipar indivíduos para este SNP, mas eles demandam extensiva otimização das condições de PCR (Polymerase Chain Reaction) ou alto custo de reagentes e equipamentos. O objetivo deste estudo foi desenvolver um método simples e eficiente para detectar o polimorfismo rs2227306 no gene IL8 e também realizar a comparação interétnica da distribuição genotípica em diferentes populações. O método ACRS (The Amplification-Created Restriction Site) foi usado para a genotipagem de 174 indivíduos brasileiros saudáveis (brancos n=148; negros n=26). Observou-se que o presente método foi eficiente, reprodutível e acurado, tendo sido os genótipos confirmados por sequenciamento. O subgrupo de brasileiros brancos mostrou uma distribuição genotípica similar ao HapMap CEU europeus (p=0,49), mas foi diferente da população alemã, PGA afro-americano e HapMap africanos subsaarianos (p<0,05). A distribuição genotípica em negros brasileiros foi similar àquela reportada por PGA afro-americano (p=0,635), porém foi diferente dos africanos subsaarianos, HapMap-CEU europeus e alemães. A comparação interétnica demonstrou que a população que carregava o alelo T em maior frequência foi a dos alemães (45,7%), a dos africanos subsaarianos, em menor frequência (6,7%). A população brasileira que é etnicamente miscigenada mostrou uma frequência intermediária do alelo T. Concluiu-se que este método ACRS para genotipagem do SNP rs2227306 no gene IL8 foi muito acurada, simples e conveniente para laboratórios com tecnologia limitada. Acredita-se que esta técnica é útil para genotipagem em estudos de associação caso-controle e genética de populações.
Publicado
2009-06-08
Edição
Seção
Artigos Originais
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